Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXL3P58215 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms