Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP4P57796 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP4P57796 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP4P57796 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP4P57796 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP4P57796 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP4P57796 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP4P57796 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP4P57796 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP4P57796 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP4P57796 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CABP4P57796 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABP4P57796 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABP4P57796 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABP4P57796 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CABP4P57796 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CABP4P57796 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CABP4P57796 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CABP4P57796 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CABP4P57796 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms