Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF1P55201 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms