Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MANFP55145 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MANFP55145 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MANFP55145 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MANFP55145 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MANFP55145 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MANFP55145 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MANFP55145 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MANFP55145 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MANFP55145 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MANFP55145 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MANFP55145 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MANFP55145 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MANFP55145 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MANFP55145 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MANFP55145 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MANFP55145 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MANFP55145 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms