Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMTNP53814 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMTNP53814 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMTNP53814 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMTNP53814 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMTNP53814 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMTNP53814 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms