Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPAP53621 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPAP53621 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPAP53621 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPAP53621 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPAP53621 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPAP53621 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPAP53621 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPAP53621 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms