Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms