Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms