Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX5P50542 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX5P50542 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX5P50542 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX5P50542 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX5P50542 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX5P50542 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX5P50542 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX5P50542 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX5P50542 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX5P50542 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX5P50542 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms