Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPFP49454 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPFP49454 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPFP49454 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPFP49454 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPFP49454 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPFP49454 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPFP49454 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPFP49454 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPFP49454 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPFP49454 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPFP49454 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPFP49454 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPFP49454 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPFP49454 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPFP49454 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPFP49454 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms