Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC11A1P49279 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms