Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME1P48163 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ME1P48163 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ME1P48163 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME1P48163 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME1P48163 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ME1P48163 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME1P48163 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME1P48163 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ME1P48163 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME1P48163 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME1P48163 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME1P48163 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME1P48163 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME1P48163 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME1P48163 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME1P48163 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME1P48163 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME1P48163 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME1P48163 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ME1P48163 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME1P48163 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms