Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSFP46459 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSFP46459 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSFP46459 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSFP46459 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSFP46459 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSFP46459 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSFP46459 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSFP46459 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSFP46459 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSFP46459 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSFP46459 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSFP46459 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSFP46459 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSFP46459 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms