Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR1P43307 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR1P43307 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR1P43307 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR1P43307 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR1P43307 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR1P43307 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR1P43307 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR1P43307 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR1P43307 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR1P43307 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR1P43307 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR1P43307 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR1P43307 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms