Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NCAPD3P42695 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCAPD3P42695 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NCAPD3P42695 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NCAPD3P42695 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NCAPD3P42695 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms