Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDH1P40925 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDH1P40925 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MDH1P40925 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDH1P40925 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDH1P40925 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms