Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
THPOP40225 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THPOP40225 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THPOP40225 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THPOP40225 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THPOP40225 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THPOP40225 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THPOP40225 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THPOP40225 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THPOP40225 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THPOP40225 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THPOP40225 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THPOP40225 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
THPOP40225 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THPOP40225 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THPOP40225 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms