Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YJR026WYJR026W 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YJR028WYJR028W 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YAR010CYAR010C 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YML040WYML040W 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YML045W-AYML045W-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YMR051CYMR051C 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 CCM1YGR150C 2595 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 FUN30YAL019W 3396 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YDL162CYDL162C 357 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 FRQ1YDR373W 573 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 TTI2YJR136C 1266 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YLR230WYLR230W 306 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 TMC1YOR052C 453 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 ROG1YGL144C 2058 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 MGA1YGR249W 1371 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YME2YMR302C 2553 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 SEC27YGL137W 2670 nt2.44□□□□□ -2.02
CCS1P40202 CLD1YGR110W 1338 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 CEP3YMR168C 1827 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 VMA8YEL051W 771 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 RRT13YER066W 558 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 COS8YHL048W 1146 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YKR033CYKR033C 426 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 STP1YDR463W 1560 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 RIF1YBR275C 5751 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 CAF120YNL278W 3183 nt2.43□□□□□ -2.02
CCS1P40202 DBP7YKR024C 2229 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 DAP2YHR028C 2457 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 RIM1YCR028C-A 408 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 HAT2YEL056W 1206 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 PEX11YOL147C 711 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YOR385WYOR385W 873 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 SEC15YGL233W 2733 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 DSF2YBR007C 2211 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 INP52YNL106C 3552 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 BEM4YPL161C 1902 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 NMA111YNL123W 2994 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 MIC60YKR016W 1623 nt2.42□□□□□ -2.02
CCS1P40202 BNA4YBL098W 1383 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 MRH1YDR033W 963 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 BMH2YDR099W 822 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YPR1YDR368W 939 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 AST2YER101C 1293 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 PEF1YGR058W 1008 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 ERV29YGR284C 933 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 RIM9YMR063W 720 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 PPA2YMR267W 933 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YPR150WYPR150W 522 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 CNS1YBR155W 1158 nt2.41□□□□□ -2.02
CCS1P40202 ESL2YKR096W 3588 nt2.4□□□□□ -2.02
CCS1P40202 PUS9YDL036C 1389 nt2.4□□□□□ -2.02
CCS1P40202 YDR249CYDR249C 1122 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 PHO92YDR374C 921 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SDT1YGL224C 843 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YJR111CYJR111C 852 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RPL15AYLR029C 615 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 ILV5YLR355C 1188 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 MEF1YLR069C 2286 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 MRS2YOR334W 1413 nt2.4□□□□□ -2.03
CCS1P40202 FLO11YIR019C 4104 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 DUF1YOL087C 3351 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RPL23BYER117W 414 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YGR273CYGR273C 525 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 ATG27YJL178C 816 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 PPT2YPL148C 522 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 BCK1YJL095W 4437 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 DSN1YIR010W 1731 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SLH1YGR271W 5904 nt2.39□□□□□ -2.03
CCS1P40202 OAF3YKR064W 2592 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YDR491CYDR491C 492 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 HMF1YER057C 390 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SLI1YGR212W 1407 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 NDJ1YOL104C 1059 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 PHO5YBR093C 1404 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 CYR1YJL005W 6081 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 ECM29YHL030W 5607 nt2.38□□□□□ -2.03
CCS1P40202 GAT2YMR136W 1683 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 CBP2YHL038C 1893 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YGR067CYGR067C 2415 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 AIM25YJR100C 984 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SEC65YML105C 822 nt2.37□□□□□ -2.03
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