Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP12P39900 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP12P39900 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP12P39900 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP12P39900 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MMP12P39900 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MMP12P39900 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MMP12P39900 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MMP12P39900 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP12P39900 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP12P39900 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms