Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPB2P35606 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPB2P35606 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPB2P35606 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPB2P35606 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms