Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD13P35453 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms