Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFC1P35251 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFC1P35251 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFC1P35251 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC1P35251 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC1P35251 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFC1P35251 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC1P35251 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms