Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA4P35212 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA4P35212 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA4P35212 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA4P35212 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA4P35212 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA4P35212 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA4P35212 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA4P35212 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA4P35212 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms