Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM5P33992 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM5P33992 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM5P33992 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM5P33992 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM5P33992 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM5P33992 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM5P33992 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM5P33992 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM5P33992 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM5P33992 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM5P33992 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM5P33992 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM5P33992 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM5P33992 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM5P33992 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM5P33992 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM5P33992 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM5P33992 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms