Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR5P32302 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms