Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms