Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms