Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms