Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4BP23588 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF4BP23588 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.4 ms