Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMPD1P23109 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms