Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms