Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRHP20396 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRHP20396 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRHP20396 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRHP20396 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TRHP20396 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRHP20396 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
TRHP20396 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRHP20396 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRHP20396 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRHP20396 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRHP20396 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRHP20396 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRHP20396 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TRHP20396 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRHP20396 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRHP20396 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRHP20396 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRHP20396 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRHP20396 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRHP20396 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRHP20396 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRHP20396 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRHP20396 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRHP20396 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRHP20396 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRHP20396 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRHP20396 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRHP20396 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRHP20396 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TRHP20396 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRHP20396 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRHP20396 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRHP20396 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRHP20396 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRHP20396 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRHP20396 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TRHP20396 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRHP20396 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRHP20396 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRHP20396 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TRHP20396 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRHP20396 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRHP20396 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRHP20396 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRHP20396 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRHP20396 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRHP20396 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRHP20396 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRHP20396 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRHP20396 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRHP20396 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRHP20396 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRHP20396 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms