Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD33P20138 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD33P20138 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD33P20138 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD33P20138 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms