Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNNI3P19429 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms