Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms