Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB2P17787 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms