Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DESP17661 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DESP17661 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DESP17661 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DESP17661 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DESP17661 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DESP17661 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms