Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA1P15085 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA1P15085 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA1P15085 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA1P15085 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA1P15085 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA1P15085 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA1P15085 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA1P15085 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms