Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC130P13994 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms