Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT10P13645 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT10P13645 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT10P13645 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT10P13645 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT10P13645 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT10P13645 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT10P13645 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT10P13645 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT10P13645 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT10P13645 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT10P13645 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT10P13645 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT10P13645 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT10P13645 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT10P13645 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT10P13645 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT10P13645 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT10P13645 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT10P13645 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT10P13645 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT10P13645 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT10P13645 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT10P13645 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT10P13645 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms