Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN1P12814 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN1P12814 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms