Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms