Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41P11171 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41P11171 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41P11171 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41P11171 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41P11171 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41P11171 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41P11171 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41P11171 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41P11171 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41P11171 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41P11171 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41P11171 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms