Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NR2F1P10589 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms