Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRSS56P0CW18 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRSS56P0CW18 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms