Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EGFRP00533 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EGFRP00533 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EGFRP00533 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EGFRP00533 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EGFRP00533 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EGFRP00533 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EGFRP00533 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EGFRP00533 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EGFRP00533 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EGFRP00533 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EGFRP00533 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EGFRP00533 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EGFRP00533 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
EGFRP00533 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EGFRP00533 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EGFRP00533 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms