Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNTO95613 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNTO95613 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNTO95613 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNTO95613 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNTO95613 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNTO95613 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNTO95613 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNTO95613 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNTO95613 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNTO95613 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNTO95613 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNTO95613 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCNTO95613 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCNTO95613 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCNTO95613 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCNTO95613 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNTO95613 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNTO95613 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNTO95613 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNTO95613 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms