Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1O95476 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1O95476 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms