Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRATO95237 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRATO95237 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRATO95237 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRATO95237 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRATO95237 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRATO95237 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRATO95237 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRATO95237 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRATO95237 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms