Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3BO75182 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms